机魂末世录

　　1989年，日本。
　　乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。

鸣人和佐助的因缘之战结束2年之后，木叶忍者村临近冬日的祭典。鸣人在拉面店“一乐”与一同成长起来的同伴们正度过着快乐的时间。在那之中，带着自己偷偷编织的围巾的雏田仍然没能传达自己的心意。雏田对于只能一直在旁边守望的自己感到厌恶。这时，一个神秘的男人突然现身了。千钧一发之际，鸣人前来搭救了雏田，但那个男人却留下“你们将迎来灭亡的命运。就在这时，伴随着强烈的光芒，陨石贯穿了夜空…… 五影会谈紧急开幕。在那里就座的是各国的首长雷影、水影、土影、我爱罗。月球不断靠近地球，其残骸将会落向地面，可以说人类灭亡的倒计时已经开始了。忍者们为此陷入混乱。鸣人与小樱、鹿丸、佐井以及雏田开始展开调查，并到达了一个刻着巨大咒印的异质地底空间。在那里等着他们的是，“某个计划”以及大筒木舍人。这个男人的真实身份是曾经与鸣人、佐助展开殊死决斗的查克拉之祖大筒木辉夜的子孙。在那瞬间，率领着傀儡队的舍人现身，以压倒性的力量将鸣人等人击倒。雏田也终于落入了舍人的手中。与此同时，地面上的人们与不断降落的陨石所进行的壮烈防卫战也即将迎来极限。舍人终于道出的“真正的最终计划”究竟是！？大筒木一族，以及雏田她们的日向一族之间的悲哀宿命究竟是！？即将到来的地球最后之日，众人各自心怀不屈的意志，超越时空展开激烈的冲突！

　　 再次相见的露易斯和才人。据才人所说，在森林中倒下时为一漂亮的妖精所救，总算是保住了性命。与才人的距离更近了一步的露易斯终于能够坦率的面对自己的心情 　　 露易斯和才人受到安莉艾塔的命令和谢丝塔一起，踏上了寻找拥有不可思议力量的精灵之旅。旅途中，对于才人看待自己的心情感到不安的露易斯，渐渐对才人开始冷淡起来，于是两人的关系变得僵硬。终于在阿尔彼奥的森林中发现了金发的妖精少女缇法尼艾的露易斯一行，对于那个不可能听到的声音感到愕然。无意识的懒懒散散的才人终于惹怒了露易斯…… 　　由于在意决定来到学园的美少女缇法尼艾以及寄情于才人的谢丝塔，使得露易斯不能很好整理自己的心情。另外，连安莉艾塔女王都？！一方面是恋爱大混战的展开，另一方面看不见的敌人也慢慢的袭向露易斯……

在某个城市中存在着不为人知的被称为Amazon的吞噬人类的异形的存在。它们的数量，竟达到4000只。制造出这个怪物的元凶正是野座间制药公司！命令名下的野座间Peston Service驱除班秘密处理“Amazon”。                                    
                               　　就是在这种情况下，在清洁干净的房屋中一步也不出去的平稳生活着的青年水泽悠和只靠野生的直觉和战斗力的像野兽一样的活着的男人鹰山仁相识，慢慢懂得了在“Amazons”的激烈的生存斗争中生存下去的故事。

　　年幼的爱力克兄弟十分思念去世的母亲，不惜触犯炼金术中最大的禁忌，进行了人体炼成。可是炼成失败了，哥哥爱德华失去了左腿与右臂，弟弟阿尔冯斯失去了肉体，只能把灵魂附身在一副铠甲上。为了偿还他们自己的罪，找回失去的一切，兄弟二人踏上了寻找传说中的“贤者之石”的旅程。
　　几年后，一位右臂与左腿都是由“机械铠甲”替代的国家炼金术士出现在人们的眼前，他被称作“钢之炼金术师”。