这是《福音战士新剧场版》的第四部，也是最终版。美里以及她的反 NERV 组织 Wille 来到巴黎，这里被核心染成红色，奇迹号战舰的船员降落在安全塔上，他们只有720秒能修复这个城市。 NERV的福音战士群出现时，真理的EVA改八号机进行拦截。与此同时，真嗣、明日香和绫波丽（暂定名）在日本的土地上徘徊。
故事发生在圣夜学园之中，日奈森亚梦（伊藤加奈惠 配音）是就读于五年级的女生，外表看来，她沉默寡言特立独行，可实际上，那不过是亚梦害羞的表现罢了，在内心里，她亦希望能够和同学们打成一片，和睦相处。一次偶然之中，亚梦得到了心灵之蛋，从蛋中孵出的守护甜心，即是她理想中的自己。 拥有了守护甜心，亚梦被邀请进入了校园里名为“守护者”的组织之中，亚梦得知，守护者们正在寻找一颗名为守护胚的魔法蛋，只要拥有了这枚魔法蛋，便能实现任何愿望。同样在寻找着守护胚的还有名为EASTER的神秘集团，他们不择手段的依靠腐化他人的心灵来达到自己的目的。
1999年一个名为巴勒莱亚的邪恶机械帝国于月球建立了基地并向地球上的人类宣战。多个国家的大城市都被巴勒莱亚的先头部队所炸毁而日本正是下一个目标。 但人类不会屈服于这种威胁，由国际空军（U.A）的小组成员所选拔的成员组成“U·A·O·H=オーレンジャー”。并利用超古代文明遗留下来的“超级力量”来武装对付巴勒莱亚。
尽管具备能毁灭人类、精灵，甚至是众神的力量，暴虐魔王阿诺斯却厌倦了永无止尽的斗争，梦想着和平的世界进行转生。然而在两千年后，转生后的他所迎来的，却是适应和平生活而变得过于弱小的子孙们，以及各种衰退至极的魔法。阿诺斯虽然进入了把被认定是魔王转生者的人召集起来「魔王学院」就读，学院却无法看出他的实力，使他被盖上不适任者的烙印。在众人都瞧不起他的环境里，他将唯一亲切对待自己的少女米夏纳为部下，不适任者（魔王）在魔族的阶级制度上迈向巅峰。 经历过各种事件后，接着将进入下一篇章《大精灵篇》！在阻止了魔族与人类的战争后，出现在阿诺斯面前的是打算毁灭暴虐魔王的新「神之子」……面对各种不讲道理的情况也一派轻松的《不适任者》将面临全新挑战！「转生到这个和平的时代，我也学会如何手下留情了呢。」
在某个平凡的夏日，东京遭到了炸弹恐怖袭击。导致日本从平稳的睡梦中惊醒的犯人，仅仅是两个少年。自称为“斯芬克斯”的犯人们，将把全日本卷入一场壮大的游戏。
主人公是超级有钱的大家族中的大小姐富士原苗香，她的父母乘坐的飞机突然神秘失踪，而苗香只有到了18岁才能取得财产继承权，为了保护直系孙女，苗香的爷爷大富士全重郎从他的“女仆王国”中挑选了两位无论是相貌还是身手都高人一等身怀绝技的忍者做苗香的保镖兼照顾生活起居的女仆。这两位忍者，一位是颇有大姐姐风范的治愈系女仆，另外一个则是终日套着假面的精壮肌肉男兼心理变态者……。号称“为了主人我什么都愿意做”的古怪“女仆”究竟能否保护女主人的安全呢？
