平静的风吹过美丽的大地——阿斯特莱亚大陆。在大陆的某个角落，失去记忆的少年佑树醒了过来，照顾他的小小指引者可可萝、总是饿肚子的美少女剑士佩可莉姆、有一点冷酷的猫耳魔法少女凯露，在命运的指引下，他们创立了名为“美食殿堂”的公会。现在，佑树和她们的冒险揭幕了。
离开死者之街过去了两年，威尔也已经17岁了。 作为领主，他发展了“灯火河港”，渐渐地，“兽之森”恢复生机。 但是，不合季节的花朵绽放，森林出现异常。为了解决这个问题而前往森林深处的威尔等人，从森林之王那里得到了不祥预言。 “铁锈的山脉上，会发生‘黑灾之火’，火会熊熊燃烧将这片土地全部烧毁。” 在灭亡的矮人之都“铁锈山脉”中沉睡的灾难是？与新的相遇一起，威尔他们的冒险再次开始！
故事发生在一个人魔共存的世界之中，格斯（岩永洋昭 配音）是一名身形强壮的雇佣兵，在战场中杀人如麻所向披靡，然而，格斯虽然看似无坚不摧，但痛苦和孤独始终折磨着他的内心，让他无法获得安宁。一次偶然中，格斯遇见了由格里菲斯（樱井孝宏 配音）所领导的鹰之团，格里菲斯热情的邀请格斯加入他们的队伍之中。 骁勇善战，巾帼不让须眉的千人长卡思嘉（行成桃姬 配音）、性情温和足智多谋的捷度、年轻却深受器重的里基特（寿美菜子 配音）、身材魁梧但性情老实的比宾，在鹰之团里，格斯结识了这些志同道合的伙伴们，彼此之间结下了深厚的情谊。哪知道，就在鹰之团逐渐得到了国王的器重的同时，格里菲斯为了获得超人的力量而将所有的团员们都献祭给了恶魔。
故事发生在名为恩典农场的孤儿院内，在这里生活着很多失去了亲人，无家可归的孩子们，他们共有36人，每天，在劳作和玩耍之余，孩子们还要进行学习和测验，其中，佼佼者是名为艾玛（诸星堇 配音）的女孩和名为诺曼（内田真礼 配音）的男孩。负责管理和看护这些孩子们的女性名叫伊莎贝拉（甲斐田裕子 配音），孩子们喜欢喊她“妈妈”。每过一段时间，都会有一个孩子被收养离开农场，生活在这里的孩子们都将此作为自己的人生目标。 一次偶然中，艾玛发现了隐藏在这座孤儿院背后的秘密，那些离开的孩子根本就没有被领养，而是被屠宰了，生活在恩典农场的孩子们，其实就是这座农场所饲养的“牲畜”。
小津一家独自居住在一栋西式大宅里。其一家之主是深雪、与经营自营农园的长子・莳 魔法战队魔法连者标志 魔法战队魔法连者标志 人负责养育著其余四个孩子，一个过著普通生活的家庭。 就在一个星期日的早上，在一家人的面前出现了一个魔法阵，而从里面居然跑出一个丑恶的妖怪。就在孩子们不知如何是好的时候，妈妈深雪拿出一个造型奇妙的移动电话，并且用它变身成像是穿着白色战衣的天使一般的形态，将妖怪两三下打倒。 回到家后，深雪告知惊讶不已的孩子们说。先前所打倒的妖怪是为了侵略地上界而曾被“天空圣者”所封印的地底冥府印菲西亚的冥兽。自己是为了与复活的印菲西亚战斗，授以天空圣者的魔法可变身成魔法使・魔法圣母。而且孩子们也与自己同样拥有魔法使的资质……
在“神化”时代的东京，充斥着无数的英雄——“超人”。 他们的诞生理由各有不同。 既有被邪恶组织改造的人，也有来自宇宙的人。 既有来自魔法世界的人，也有来自古代、身为妖怪而生的人。 既有被科学家制造出来的机器人，也有超自然的史前机器人。 对于这些超人的跋扈，日本政府绝不打算坐视不管——
经过1800年的岁月洗礼，源自古老中国大陆的暗杀拳——北斗之拳终于迎来最强盛的时刻。掌门人琉泉收养的四位养子：拉奥、托奇、加基和健四郎经受住无数磨练，早已锻炼出强壮之躯。为了防止武功外泄，千百年来北斗之拳都严守着单子相传的铁规。面对四个强大的养子，琉泉最终选择更具悲悯之心的健四郎为继承人。这一决定，也导致了四兄弟的分道扬镳。与他们一同长起来的，还有自幼失去父母的尤莉亚。尤莉亚对健四郎心有所属，情愿与之绝走天涯。尤莉亚圣洁、美丽，不仅健四郎为之倾倒，拉奥、托奇甚至南斗水鸟拳的殉也深爱着她。也由此，这群末世英雄谱写了一段段悲壮感人的传奇诗篇…… 本片根据原哲夫、武论尊的经典漫画原著《北斗神拳（北斗の拳）》，是《真救世主传说 北斗神拳》的第二部。
