本动画讲述了在一个平和安宁的小镇上，人类与恐龙生活在一起。但恐龙们总是会闹出这样那样的问题，例如贪吃的速龙吃掉小朋友的早餐，庞大的雷龙碰倒马路上的电线杆，剑龙妈妈的蛋不见了，等等。这时候，维护恐龙小镇安宁的帮帮龙小队就会出动，帮忙协调人类与恐龙之间的矛盾，以及帮忙解决他们的困难。最终在帮帮龙小队的帮助下，小朋友们与恐龙成为朋友，一起在小镇快乐地生活。
皇太子在一次民间出巡，邂逅了一位民间女子。这位女子为皇太子诞下一名女儿。适逢盗贼作乱，皇太子与母女俩失散。数年后，皇太子已登基成为皇上，并寻回失散的女儿──甜丝丝。丝丝在民间流落多年，沾染了民间的市井习气，加上生性懒散，皇上为之头疼。皇上为了让丝丝成为一个高贵的格格，于是把她送进尚书房学习。甜丝丝格 格那顽皮、爱捣蛋的可爱性格为皇宫带来了新冲击，故事亦由此而起。此后，甜丝丝认识了尚书房班长心柔柔、从西洋归来的华伦，以及后备武状元白米饭。这四位好友与讨厌小朋友的大臣王坤，在皇宫发生连串趣事。
西行小队离散后，沙悟净下阴界救师父；白狼小羽在恐怖森林收服一虎，又在古城被石兵围困，三藏等人归来解围，三藏化解亡魂怨恨，西队亦告别故人，继续上路。
少年秦烈与同伴在秘境中力挫各方势力的青年才俊，秦烈不但成功收服了木、火、雷、冰四灵兽和封魔碑，还在秘境之中意外获得了各方势力觊觎已久的神秘宝藏。就在秦烈一行尚且沉浸在秘境试炼获胜的喜悦之中时，暴乱之地各方豪强却已大军压境。面对来犯的强敌，秦烈一行能否全身而退。秦烈扑朔迷离的身世以及他挂念许久的青梅竹马——凌语诗的下落，都将伴随着灵域大陆这一次又一次的争斗，逐渐为您揭开谜底。
特别篇动画《秦时明月之罗生堂下》是独立于动画《秦时明月》正传剧情之外的短篇番外故事。该动画讲述少司命年纪轻轻就从阴阳家弟子成为了阴阳家五大长老之一的经历。
