「魔法使いさん、わたし、約束守れませんでした……」 魔法使いに憧れる天然少女クルミ＝ミライと、 代々魔法使いを輩出する名家の令嬢ユズ＝エーデル。 レットラン魔法学校＜国家魔法師養成専門学科（通称・マ組）＞への進学は魔法使いになるための必須条件。 なのに、まさかの受験失敗………と思っていたら⁉ 一見、子どものような国家魔法師ミナミ＝スズキが担任として現れ、 学園生活は急転！訳ありげなクラスメイトに、怪しそうな同好会…… この学校に隠された秘密って何⁉ 魔法使いさん、わたし＜普通科一組＞で、魔法使いになれる、の、カナ……？ 夢に破れた正反対なふたりの少女の青春＊魔法学園ファンタジー！
1989年，日本。 乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
由CCG发起的对「枭」的讨伐战的12年前—。 东京13区内，名为「灯笼」的食尸鬼频频捕食人类，成为了CCG的搜查目标。 高中生·富良太志，受因为伤痛而无法继续打棒球的挫折的影响，与曾经的队友兼挚友的阿凉与阿秋一起做起了不良少年。 后来，与阿凉交恶的太志离开了两人，开始了独自行动。凉与秋虽然担心着太志，但也难以向太志启齿表明。 某一日深夜，与不良集团在一起的凉与秋被「灯笼」所袭击。正巧经过的太志，想要救助两人却敌不过食尸鬼。这时，同班同学·有马贵将出现了——
讲述了少女真宫樱自从幼年时被堕魔死神带离之后，获得看见幽灵的能力。在学校里樱遇见具有死神血统的同学六道轮回，随后真宫樱和六道轮回一起引导幽灵至轮回之轮。
