男主苏阳对滑步车运动十分热爱，一直梦想着要当一名了不起的骑手；在退役仪式上，冠军王超将奖品“电光轮组”作为礼物赠给了苏阳。在追逐梦想的过程中，通过不断克服困难与挑战，苏阳激活了灵兽力量，获得了闪电飞狐的能力，并认识了其他拥有灵兽力量的小伙伴们，他们一起组建了俱乐部小队来到更大的赛场，向着更强的对手发起挑战，故事的序幕就此拉开。
在浩瀚的宇宙中，有一个人类、机器人、外星人共同生活的地方，叫“星星球”。某天，灰心星球的宇宙开发公司派出了两大王牌战士“大大怪将军”和“小小怪下士”并携带着拥有强大力量、赋予机器生命和智慧的终级武器——五色神奇宝石，想强行占领“星星球”，可是，当他们冲进大气层时发生了意外，除了黑色宝石外，红色、粉红色、绿色、蓝色宝石都散落到星星球。在星星球上有一位天才的机械师——宅博士，在维修垃圾电器时，四台旧机车刚好遇上了四颗宝石，在无意中激活了它们；从此，开心超人、甜心超人、花心超人和粗心超人诞生了。他们在宅博士的带领下，一次又一次地挫败了侵略者的阴谋，保护了“星星球”。
经过五进三总选赛，作为胜利者的清歌、玉藻、罗兹进入到了下一轮的训练中。三人被告知接下来的特训将以全新的模式展开，在新的特训中，等待她们的将是什么样的挑战呢？另一边，虽然总选赛失败，但实际成绩并不差的两位歌姬，在伊贞的高层和教官的博弈中，又会迎来什么样的命运呢？
经历了两个冒险事件的吴邪从南沙回到杭州后，在修养期间，突然接到了久未谋面的发小老痒的电话。老痒和吴邪讲述了自己三年前在秦岭山腹地的冒险见闻，并邀请吴邪一同前去冒险，再探上古遗迹。吴邪和老痒出发前往了秦岭山脉探险，在这里，他们见到了巨大的哲罗鲑、壮丽的地下河瀑布、不可思议的上古神树…而一直神出鬼没的张起灵，竟也在暗中帮助着吴邪。
《神兽金刚3超变星甲》是神兽金刚第三季作品。剧情延续神兽金刚2天神地兽。
