ROY6 minini 是生活在森林里的一群神秘小生物，它们住在一座大树公寓里，过着和人类一样的生活。有时它们也会意外闯入到人类的世界，但因为太小了，根本不会有人注意到它们的存在。它们究竟是什么，怎么来到这的，没有人知道…但这一点也不影响ROY6 minini们在大树公寓里愉快而又充实的生活。
每当大象市出现危机时，就会有三个铠兽超人挺身而出，他们就是阿呜、浣影和蓝方包。某天，阿呜家来了个名叫依乐的智能生命，她告诉阿呜他们，智能次元出现了一个叫零的邪恶的智能生命，它企图统治整个人类世界，并感染了其他智能生命，导致它们暴走，引发了一系列的破坏和灾害。为了保卫城市，阿呜三人和依乐组成了全新的铠兽战队。
神州浩土，万物有灵，与精灵结成伙伴的天才被称为御灵师。被封印百年的少年石大力意外遇到了来自平行世界的御灵伙伴九尾天狐青青，踏上了成为首席御灵师、寻找自己身世之谜和守护世界的道路。
