本季延续《西行纪》前一季剧情，讲述了唐三藏与师徒四人取得奇经交予天宫的十六年后，为了心中正义，再次集结成“西行小队”，重新踏上“还经”之路的故事。
十方天域，强者为尊，少年林天被未婚妻萧韵联合莫家长子莫森骗光了家产，还被推下悬崖。侥幸未死的他终于幡然醒悟，决心向两家复仇，夺回属于自己的一切，在悬崖之下，他偶获神秘黑铁剑，此剑暗藏神功，竟助他炼成无上武道。因实力不足，他决定先拜入九阳武府，待实力成熟后再行复仇，不料武府长老却是莫森的大伯，林天内外交困，危机重重。林天开始低调行事，苦修武道，精修符阵之法，暗中出城历练，战赤面鬼，杀百足兽，夺血魂花，奇遇不断。他的实力飞速增长，萧莫两家却仍不知悔改，埋伏、暗杀，甚至发动全家势力进山围剿，而林天神功大成，自以一剑破之。且看少年林天如何喋血复仇，历经磨难，终成神王，一统十方之天界！
温氏横行，生灵涂炭。江湖仙门义士发动“射日之征”，合力讨伐温氏。“夷陵老祖”魏无羡虽在推翻温氏中立下了汗马功劳，却因修非常道且太过强大而遭人忌惮坑害，致万人唾骂，被情同手足的师弟带人端了老巢，身陨形灭…… 十三年后，魏无羡被人献舍，并再度与姑苏蓝氏蓝忘机、云梦江氏江澄等旧人相遇，前尘谜团未消，江湖疑云再起。 而这一切恩怨情仇，都要从他们少年时说起……
经历了两个冒险事件的吴邪从南沙回到杭州后，在修养期间，突然接到了久未谋面的发小老痒的电话。老痒和吴邪讲述了自己三年前在秦岭山腹地的冒险见闻，并邀请吴邪一同前去冒险，再探上古遗迹。吴邪和老痒出发前往了秦岭山脉探险，在这里，他们见到了巨大的哲罗鲑、壮丽的地下河瀑布、不可思议的上古神树…而一直神出鬼没的张起灵，竟也在暗中帮助着吴邪。
