与莉可、罗伊以及帕底亚地区的三只最初的宝可梦们一起踏上激动人心的宝可梦世界冒险之旅吧！
在美国西海岸的中心城市，憧憬着HERO的少年Joey一边打工，一边和祖母二人快乐地生活。某天，Joey捡到了一个破烂机器人玩具并着手修理它，然后为它起名叫“HEROMAN”。之后的某天夜晚，一度强力的闪电击中了Joey家，机器人玩具被雷光包围，化身成一个拥有电击能力的巨大机器人“HEROMAN”。然后，迷之生命体也开始了对地球的侵略。
住人公是一个名叫饭冢和人的中学生，除了酷爱动画片他与别的少年没有丝毫不同。某个雨天，和人的注意力给一只被遗弃的可爱"小狗"吸引了，幸好得到一个言行举止怪异的少女七濑成惠(父亲是到地球侦查的外星人，母亲侧是地球人的星际混血儿七濑成惠，由于出身特殊，成长过程的14年的中一直过着没有朋友的生活，)及时出手相救才幸免被外星怪物所伤，于是开始了他们的交往生活。后来饭冢和人才意外发现成惠是个在地球上长大的外星人。她拥有瞬间移动的特殊能力。第一次的约会，和人在丸尾的指导和跟踪下开始行动。虽然事情的进展和丸尾所说的有极大的差别，但在和人的努力下最后还是赢得了成惠开朗的笑容。随着感情的上升，成惠要求到和人的家里，这使得他大为惊喜。可惜不幸被成惠看到他的成人刊物，在匆忙扯开话题后二人开始看动画片，感觉到很开心的成惠对和人送了一份特别的礼物。以七濑成惠与饭冢和人两人为主轴的恋爱故事，就此展开了…
故事发生于位于本州南部的一座孤岛之上，从前，这里是一片热闹的景象，直到有一天，一个大企业买下了岛上的大部分地皮，准备在这里建造工厂，很多居民因此而选择了搬家，渐渐的，小岛变得又冷青又荒芜。 星野航（中村悠一 配音）是在岛上学习生活的高中二年级男生，某日，他所在的学校里转来了一位名叫泽城凛奈（河合春华 配音）的女生。对于这个人员不断流失的小岛来说，新鲜血液的加入是一件多么新奇的事情啊！泽城凛奈究竟为什么会从热闹的大城市转学来到这座萧条的学校里呢？没过多久，泽城就交到了羽山海己（石川乃奈 配音）、浅仓奈绪子（筱崎双叶 配音）、六条宫穂（草柳顺子 配音）等好友。
