忍者神威

数千年后的未来，进入宇宙空间的人类，                                                                      　　被分为银河帝国与自由行星同盟这两个                                                                      　　拥有“专制政治”与“民主主义”两种不同政治体制的国家。                                                                      　　两国之间的抗争持续了150年，                                                                      　　以无边无际的广袤银河为舞台，                                                                      　　重复着无止境的战斗。                                                                      　　银河帝国的门阀贵族社会的腐败，                                                                      　　以及自由行星同盟可称为民主主义的弊端的群愚政治                                                                      　　侵蚀着两个国家。                                                                      　　之后，宇宙历8世纪末，两位天才的登场驱动了历史。                                                                      　　“常胜的天才”莱因哈特·冯·罗严克拉姆，                                                                      　　以及人称“不败的魔术师”的杨威利。                                                                      　　两人率领着帝国军与同盟军，展开了不知道是第几次的冲突。

真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香 配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下的神奇宝贝——皮卡丘（大谷育江 配音）。皮卡丘又名电气鼠，虽然长相可爱，但性格含羞内向却又不亲近人类，稍有不满就乱放电电人，暴躁的脾气让小智吃尽了苦头。大木博士把神奇宝贝图和宝贝球作为践行礼物送给了小智。在小智和皮卡丘的前方，神奇宝贝的世界有许多谜题和探险在等着他们，迎接他们的到底是光明还是黑暗，小智能否如愿成为神奇宝贝大师呢？

此為TV版動畫第三部，從1997年4月4日至1997年9月26日放映，全26話。                                                                      　　此作完全脫離原作，為動畫原創故事，原創的角色也很多。由於是動畫原創，部分設定和原作設定相矛盾，並且原本的主角：莉娜等人的存在變成了半個旁觀者。故事走向太過於沉重路線，和原作原本的作風相距甚遠，所以沒有受到與前二作相等的評價。

すべてではない。けれど、エリアスを、                                                                      　　自分を受け入れることができたチセ。                                                                      　　カルタフィルスがひとときの眠りにつき、                                                                      　　日常を取り戻した彼女の元に                                                                      　　届いたのは、魔術師たちの                                                                      　　相互扶助組織『学院』への招待状だった――。                                                                      　　大英図書館の地下……                                                                      　　今までとは違う魔術師達の社会。                                                                      　　”人”との出会いと交わりが、                                                                      　　新たな扉を開いてゆく。                                                                      　　これは、私（あなた）を救う為の物語。

　　憧憬天空、以星之岛为目标的少年，与从天而降、不可思议的蓝发少女，两人成为了命运与生命的共同体。向天空出发的少年与少女，与值得信赖的同伴和前往目的地的骑空艇相逢。经由躲避帝国的追击，以及与星晶兽的邂逅，两人加深了牵绊并逐渐成长。但前往星之岛的路程还只过了一半。少年与少女和同伴一起，向着接下来的旅程进发。