漠北当下表面平静，实则暗中涌动。王后述里朵正筹划一场大会，不良帅为探查漠北动向带着一众不良人出现在漠北，以降臣为首的四大尸祖在此期间也来到漠北开了家古董羹店，而神秘的杀人凶手更弄得人心惶惶，几方势力各怀心思....
古神之地后，修魔内海永夜魔城一夜崛起，为拓展领地，不断对修魔海周边宗门下手，其中也包括了李慕婉所在云天宗。李慕婉在护门大战中身中奇毒，性命攸关，王林得知此事后，携其再次闯入修魔内海，王林以化神初期修为力战三大城主，名震修魔内海，带回解药救下李幕婉，却发现危机并未解决，千年阴谋浮出水面。最终凭借二人情愫及化神后首次与古神之身合体，联手斩灭魔尊。
主角苏奕前世是独尊大荒的玄钧剑主，为追求无上剑道，选择转世重修，不曾想，在转世后，他最信任的大弟子勾结外敌，最宠溺的小徒弟为了得到九狱剑，也选择了背叛…… 转世后，苏奕的新身份是世俗国度大周玉京城苏氏的庶子，自幼备受冷落，怀疑母亲叶雨妃之死，和生父苏弘礼有关，为查明真相，毅然在十四岁那年离家出走，前往青河剑府修行。 不曾想，三年后，在苏奕即将成为青河剑府内门弟子时，忽然在一夜之间失去修为，沦为废人，就此成为青河剑府弃徒。 跌入低谷的苏奕，被迫接受苏家力量的安排，成了偏远小城三大宗族之一文家的上门女婿。 其妻
在西天取经后的十六年，为了抢夺奇经，一群神明打破了平静，机缘之下的狼少年加入原西行团队，命运的轮盘就此转动，重返十六年的西行之路正式开启，这一次冒险是为了最初的那个梦。
特别篇动画《秦时明月之罗生堂下》是独立于动画《秦时明月》正传剧情之外的短篇番外故事。该动画讲述少司命年纪轻轻就从阴阳家弟子成为了阴阳家五大长老之一的经历。
