《神兽金刚3超变星甲》是神兽金刚第三季作品。剧情延续神兽金刚2天神地兽。
阿狸发现这个世界上有许多人，虽然经历了成长，但是丢失了童心，变得困惑麻木和孤单。阿狸通过经历和冒险去帮助他们找回信心。期间帮助了贪吃的大仓鼠重新找到自己的定位和价值，帮助拾荒的地精收集了星星并送回天上。阿狸和桃子大熊误入了一个神秘的棋盘，通过智慧和勇气打败了骄傲的象棋白皇后。阿狸帮助了一个失去伴侣的坏脾气先生，找到失去的爱情和回忆。在小镇的剧场里，阿狸了解到了提线木偶的理想是当一个舞蹈家，阿狸鼓励他勇敢地追求自我，不要害怕失败。最终提线木偶受到了命运的眷顾。
为从美杜莎女王手中夺取异火，萧炎在药老陪同下前往蛇人族居住的塔戈尔沙漠。却因口渴误闯绿洲，引来蛇人族高手月媚追杀。没有药老逆天协助的萧炎，眼看要被月媚杀死，生死存亡之际，幸得一位蒙面斗皇相救。不料蒙面斗皇一行人也为异火而来。美杜莎女王拒绝古河交换异火的条件，蒙面斗皇戳穿女王此刻是能量体，而真正的女王在某处准备吞噬异火，进化为斗宗。蛇人族攻击冒犯女王的古河等人，萧炎也在混战中感知到异火行踪，潜入女王所在的地心岛……
20XX年某天，以人类身体为家的外星人猪王子抵达地球，却意外地发现自己要居住的人类还没出生！无处安家的猪王子，结识了同类赛几和瑞比，三位在人类身上制造出各种搞笑意外，导致人类出现秃头、口臭、头痛、情感危机等等问题。
主人公逸徇受父命前往上石郡，意欲收复政权，铲除清理当地掌权机关“玄天司”首领——葛覃。不料方到上石郡逸徇却倍受到冷遇，葛覃尽显地头蛇风范，逸徇第一战出师不利。恰逢此时少女十一月前来行刺葛覃。逸徇顺势借此事件还以玄天司众部颜色，宣告自己的主权。但十一月行刺未果遇险，逸徇好意救下十一月，不料却反被十一月绑至小树林。二人暗中交谈，逸徇从十一月口中了解到古族的往事，意识到可以利用古族之力与玄天司对抗，于是替十一月解毒，打算招募她为自己所用。不料玄天司黍离带领追兵包围小树林，二人陷入险境，葛覃也于此时现身。葛覃强行要带走十一月，不惜与逸徇爆发冲突，两伙人在树林大战。战斗中逸徇无意间触发自己古族的血脉，复刻了十一月的图腾，并且借助其灵力，带领重伤的十一月一起脱逃。逸徇在十一月的带领下前往古族圣地，从中了解了古族的历史，也确定了自己的古族身份。但二人无意间惊动镇守圣地的神兽应龙，为救十一月逸徇再次复刻图腾，激活自己体内的古族血脉。两人刚刚脱逃，便遇到了外出采药的少女楚茨。逸徇带着二人重返上石郡，在北城门处设计摆了葛覃一道，将十一月神不知鬼不觉带入了城中。逸徇入住郡守府，楚茨身份揭晓，竟然也是古族。但十一月伤势未愈，为了医治十一月，楚茨与逸徇打算一同进山寻药。彼此陌生的逸徇与楚茨二人在采药过程中相互猜忌，不幸遭遇了野熊决明。决明在看见血液后暴走，他的背后似乎有关于玄天司的秘密。于是逸徇、楚茨合力制服决明，取得草药下山回府。逸徇也终于下定决心与古族联手合力对抗玄天司，却遭到贴身护卫弈的反对，弈甚至暗中派人毁掉草药。所幸楚茨利用灵力救活草药，十一月才得救苏醒。而葛覃通过跟踪逸徇，得知了决明的下落。原来决明是玄天司研究的变异古族，于是葛覃秘密派出其他变异古族去抓捕决明...
科研潜艇“逗号”，是科幻小说《地心游记》的铁杆粉丝。为研究海底神秘物质, 跟着叔叔地质学家 “铁石号”深潜马里亚纳海沟，意外被卷入洞穴迷宫来到巨大未知世界并发现远古生物，开启了超乎想象的海底地心探险。
