终末的火车前往何方？

勇太（菅沼久义 配音）是一个普通的少年，一次偶然中，经人推荐，勇太进入了传说中的圣阿方索学院进行学习。这是一所地处月桂树环绕之中的全封闭式贵族学校，拥有完全独立的通讯系统。虽然被称作学校，但学院更多的被选择成为了名流们销声匿迹的藏匿之所。                                                                      　　勇太是全校唯一一个拥有手机的学 生，因此受到了众多学生的欢迎。在这里，他结识了正直可靠的王子乔舒亚（置鮎龙太郎 配音），前知名演员亚鲁法雷德（森田成一 配音），表面上高贵冷静，背地里却是个十足宅男的西鲁班古拉古（三宅纯一 配音）和炼金术师之家出生的腹黑男古鲁曼（野岛健児 配音）等。在相处的过程中，勇太发现，这些看似高不可攀的同学们，其实有着意外可爱的一面，从而与他们结下了深厚的友谊。

从人类开始开发宇宙开始进入A.C.（After Colony）纪年，在第一个宇宙殖民地L1完成后百年，地球统一政府对殖民地以武力实行高压统治。 在A.C.165宇宙住民对地球圈发起抗争，而在其中的调停者是非暴力非武装份子的希罗·維，并在各殖民地和地上展开演说推广其理想，但其在A.C.175遭到暗杀（其中一种说法为杀手是OZ前身的特务组织的成员），随后殖民地陷入混乱并遭到特务部队（后来的OZ前身）镇压。之后在地球上提倡和平主义的山克王国和其王室匹斯克拉福特家族也遭消灭。 A.C.195年强力反对地球统一政府强力支配的殖民地份子，对地球送入了五架高达，开始歼灭特务部队OZ的“流星作战”（Operation Meteor）。

新來的班導師木林呪理居然是個靈媒師，由於她的興趣是降靈，因此動不動就在課堂上降靈附身或是天外飛來一句令人驚恐萬分的話，不過理由都是為了教學或是出於善意要保護學生。對於降靈與超自然以外的領域一竅不通，再普通不過的日常生活，在她身上經常會有出人意表的發展，也因此鬧出許多笑話。跟著木林老師一起來學著如何與生活中的妖怪和平相處吧。

坐拥强大科学力量的帝国，以及以“魔女之国”的威名受到世人畏惧的涅比利斯皇厅。                                                                      　　在没有尽头的两国战场上，少年与少女相遇了。                                                                      　　以史上最低龄晋升帝国最强战力的剑士──伊思卡。                                                                      　　被称为皇厅最强的寒冰魔女公主──爱丽丝莉洁。                                                                      　　“若逮得住本小姐，你说不定真能实现自己的梦想呢。”                                                                      　　“你才应该将我打倒，好让你能在统一世界的路上前进啊。”                                                                      　　两人以宿敌的身份展开了廝杀。然而，少年被少女的美貌和高洁的姿态夺走了心，                                                                      　　少女也迷上了少年的强大和生存之道。即便两人无法并肩而行，唯能战至一方倒下                                                                      　　相互敌对的少年少女，将展开革新世界的英雄传奇！