人気カードゲーム“デュエル・マスターズ”を題材とした松本しげのぶの同名マンガを原作とするテレビアニメ。監督はこれまでアニメ「デュエル・マスターズ」シリーズを手がけてきた鈴木輪流郎、シリーズ構成はテレビドラマ「MUSICAL 3」「FACE-MAKER」の脚本を担当した田辺茂範、キャラクターデザインは前作「デュエル・マスターズ クロスショック」に引き続き平岡正幸。 デュエル・マスターズ伝説のデュエリストである切札勝舞の弟、切札勝太。勝太がガリ勉のベンちゃんに呼び出され公園に行くと、そこでは何とデュエマの大会が開催されていた。デュエマ嫌いの勝太は逃げだそうとするが、ベンちゃんたちのライバルであるドラゴン龍にバカにされ、怒りのあまりデュエマ勝負を挑むことになり…。
故事发生在庞大辉煌的CLAMP学院之中，作为学生会长，妹之山残（冈村明美 配音）拥有着拥有着十分强烈的正义感，一直以来都热心坚定的帮助着遭遇到不幸的人们。不仅如此，身为女性主义者的他对于女性所承受的不公更是尤为上心。 妹之山残的手下有两名得力干将，他们是出生于忍者世家的鹰村苏芳（新山志保 配音）和拥有着双重身份的伊集院玲（南央美 配音）。沉默内敛的苏芳文武双全，在心中默默许下了保护残的约定，而玲表面上看来不过是一介普通的小学生，真实身份却是大名鼎鼎的怪盗千面人。三人共同组成了名为“CLAMP学院侦探团”的团体，为了调查学院中的种种事件而做着不懈的努力。
忍びの里から抜け出したくノ一さとこは、 街で行き倒れていたところを通りすがりの女子高生このはに救われる。 だがそれも束の間、さとこは里からの追手に見つかってしまう。 しかしそんな追手をあっさりと返り討ちにするこのは。 …なんと彼女の正体は殺し屋だったのだ！ 世間知らずのくノ一と殺し屋女子高生の危ない共同生活がスタート！
