在2022年，未来战争的硝烟弥漫，人类幸存者与无尽的机器大军之间的对抗已持续数十年。1997年，被称为“天网”的人工智能获得了自我意识，宣告了对人类的战争。为了改变人类的命运，一名士兵被送回过去，她的任务是在危机前保护科学家马尔科姆。 马尔科姆（安德烈·霍兰 Andre Holland 配音）致力于研发一种新型人工智能系统，旨在对抗“天网”即将发起的攻击。然而，面对技术带来的复杂道德困境，他不仅要全力以赴推进研究，还必须躲避来自未来的无情杀手的追击。随着危机的加剧，他的三个孩子也深陷其中，命运因此被彻底改变。士兵与科学家的命运交织在一起，生死存亡的抉择将决定人类未来的走向。在这场时间交错的斗争中，士兵和马尔科姆必须克服内外的重重障碍，寻找希望的火花。只有团结一致，他们才能在这场生死较量中逆转历史，改变未来的命运。
筱原美穗（大森玲子 配音）是一个可爱的九岁小姑娘，一次偶然中，她邂逅了时间记忆精灵皮古和摩古，两个精灵将拥有魔法力量的画笔和图画本送给了美穗，就这样，美穗拥有了将画中物体变为现实的神奇能力。利用魔法，美穗将自己变成了15岁的拉拉（大森玲子 配音），并且在街上遇到了星探发掘，走上了成为模特的道路。 之后，美穗以拉拉的形象一路走红，开始拥有大批的粉丝，甚至开设了自己的个人演唱会。一场意外中，美穗将画笔和图画本弄丢了，而一直在帮助她的皮古和摩古也因为魔力耗尽而消失了。伤心的美穗遇见了自己曾经的化妆师柯米，而柯米竟然认出了眼前的女孩就是拉拉。
距今大约3万年前，地球上生活着两个高等民族——穆族和亚特兰蒂斯族。穆族人民热爱和平，以大白鲸作为图腾；亚特兰蒂斯族则以老鹰作为图腾，争强好胜，好勇斗狠。随着科学的高度发达，优渥的生活条件渐渐无法满足亚特兰蒂斯人的贪婪欲望，他们向穆族发动战争。为了避免地球灭亡，穆族和对手达成协议，即亚特兰蒂斯族从此迁至外太空，自己这一方则沉入大海，还地球以和平。 1982年，天现异相。因能源缺乏，亚特兰蒂斯族大太空大军重新飞还地球。与之相对，穆族预言者拉姆（武岡淳一 音）将大脑与大白鲸相连，构成一个强大的超级兵器。同时他们还集结了白银剑、白诚让、白鸟丽、白风信和白川学5位转生的穆族勇士。绵亘3万年的战争即将再次爆发……
个性活泼开朗有时候显得有些大大咧咧的水无月遥（田村由加莉 配音）、成熟稳重颇具大小姐风范的神无月葵（能登麻美子 配音）、从意大利转学而来的天才少女叶月胡桃（钉宫理惠 配音），活泼可爱的三人平日里在学校中是无话不谈的好友，过着平凡的校园生活，但每当夜晚来临，她们便会变身成为拥有超能力的魔法少女。 三人的目标，是寻找价值连城的天使像，邪恶而又贪婪的地下拍卖组织Black auction得到了它，企图通过它来牟取暴利。成绩优异的学生会长如月唯人（桧山修之 配音）、随叫随到的万能管家长月平之丞（清川元梦 配音），是他们在背后默默的支持着少女们。
