和命中注定的女孩子×5生活在同一个屋檐下！ 东大应届入学的秀才粕壁隼，收到祖母的讣告后回到了阔别三年的老家——海边的一间老旧咖啡厅“Familia”。但他一推开门，就看到了5个不认识的女孩！而且她们还自称是“奶奶的家人”… 本来打算把店拆了改成停车场赚钱的隼，在和女孩们相处过程中回想起与奶奶的过往，决定休学一年与五个女神一起共同生活，重新经营咖啡厅。 女主角太多的海边爱情喜剧，开幕！
题目来了。如果你有兴趣的对象邀你去约会，你会怎么做？ 而且对象不只一个，有冰山美人型学姊和可爱型儿时玩伴葵花这两大美少女！ 这种时候当然会意气风发地前往碰面地点吧？ 结果她们向我表明的「心意」是！……要找我「恋爱谘商」怎么追我的好友啊哈哈哈…… 我不干了！不干不干！ 我终于从「迟钝型无害角色」变回原来的本大爷啦，可是本大爷不会在这种时候怨天尤人。 因为只要帮她们做这恋爱谘商，说不定她们就会喜欢上本大爷啊！ 然而，有一名少女从旁看著本大爷这种悲哀的孤军奋战。 她是绑辫子戴眼镜的阴沉女──三色院堇子。 该怎么说，本大爷讨厌这女的，偏偏……喜欢本大爷的竟然就你一个？
西暦2199年、地球は宇宙人・ガミラス帝国の侵略を受けていた。ガミラスは冥王星に前線基地を建設し、地球に対して遊星爆弾による無差別攻撃を加えていた。海は蒸発し地球は赤茶けた姿に変貌し、放射能汚染で地上の生物は死滅する。人類は地下都市を建設し、地球防衛軍を結成して抵抗を続けていたが、科学力の差の前になす術もなく、地下にも放射能汚染が進行し、人類の絶滅まであと一年余りと迫っていた。 最後の地球防衛艦隊が、冥王星空域でのガミラス宇宙艦隊との交戦で壊滅し、人類生存の希望は完全に潰えたかに見えた。しかし、この海戦の最中に外宇宙から飛来した一隻の宇宙船が火星に不時着、通信カプセルが回収される。その中にはイスカンダルから、「放射能除去装置・コスモクリーナーDを受け取りに来るように」との救援メッセージと、航海に必要な波動エンジンの設計図が納められていた。極秘裏に宇宙戦艦へと改造中だったヤマトに波動エンジンが搭載され、目的が地球脱出から放射能除去装置・コスモクリーナーDの受け取りに変わる。 14万8千光年の彼方、大マゼラン星雲のイスカンダル星に向け、1年以内に帰還しなければ人類滅亡という状況下、宇宙戦艦ヤマトは人類最後の希望を託されて発進する。 ヤマトはガミラス帝国と戦い、未知の宇宙空間における障害を乗り越えながら、イスカンダル星を目指して行く。
