故事开始于一个宇宙中心的一个星球。“银河铁路”的全部的始发站迪斯特尼,主人公有紀学（ユウキマナブ）20岁，继承已故父亲和兄的意思入队守护银河铁路的安全的空间铁路警备队 (通称“SDF”)。SDF，在宇宙中维护银河铁路的运行日程的利益，因为各交通线路发生的事故，自然灾害和救命急救和宇宙海盗的讨伐等。 并与一个谜样的美女蕾拉相遇,她具有人和生物，惑星的命运的预见能力！蕾拉帮助着铁道站的旅行者们而被称为命运的守护者.然而,威胁银河铁道的最大危机迫近,而有纪的命运又会如何呢.
故事开始于冰冷而又黑暗的王国纳里亚蒂亚，为了令这个国家重新燃起生命的气息，王子命令Animaru（石馆光太郎 配音）前往人间，去寻找传说中的战士。 个性天真开朗，阳光乐观的丽（深川芹亚 配音）、看上去十分傲娇，但实际上非常会照顾人的花日（古贺葵 配音）、个性冒冒失失但成绩却十分优秀的稻穗（桑原由气 配音）成为了三名被Animaru选中的魔法少女。纳里亚蒂亚王国状况的日益恶化会影响到人类世界的运作，所以，三个女孩身上背负的，不仅仅是保护纳里亚蒂亚王国的任务，还有保护全人类。为了收集魔力，女孩们必须让更多的人绽放笑容。
19世纪英国—— 名门贵族凡多姆海夫家的执事塞巴斯蒂安·米卡埃利斯与13岁的主人夏尔·凡多姆海夫一起作为“女王的看门狗”承包了背面社会的污秽工作。 有一天，女王给夏尔寄来了一封信，信中说，在英国首屈一指的名门寄宿学校威斯顿公学上学的亲属德里克等多个学生失去了音信。 塞巴斯蒂安和夏尔为了调查事件潜入威斯顿公学。事件的真相是…？
在非常遥远的未来，人类反抗机器人的贵族统治之战即将进入尾声。故事的舞台是与世隔绝的暴风雨之塔，里面住着弗里盖琉公爵的女儿多罗斯赛露、管家凯迪西多尼斯等人，故事便是围绕着大小姐和管家两人的日常对话而展开的。
顺利升入高中的少年富樫勇太（福山润 配音）在初中时代曾是暗黑系的中二病患者，当年他自称黑炎之主人，自我感觉良好地度过了无厘头的中学生活。但是此刻他“痛改前非”，将这段经历看作不堪回首的耻辱过去，为此甚至不惜报考一个离家很远没有人认识自己的高中。在新的学校，勇太如愿以偿结 交了一色诚（保志总一朗 配音）、丹生谷森夏（赤崎千夏 配音）以及学姐五月七日茴香（浅仓幸美 配音）这样稍显正常的朋友，也准备和心仪的女孩大谈一场浪漫恋爱。但是令他备为挠头的是，楼上新搬来的住户兼同班同学小鸟游六花（内田真礼 配音）却是一个中二病的深度患者。小女孩每天唧唧歪歪，怪力乱神。好不容易摆脱初中阴影的勇太，高中恋爱之梦日渐飘渺……
