2002年，数码世界面临灭亡的危机！数码世界本是由究极天使兽、基路比兽及神圣天女兽三大天使所管治的，然而其中一位天使——基路比兽却叛变，这使得数码世界的平衡受到破坏，并开始崩溃…… 古代曾经拯救数码暴龙世界的十斗士现在已不存在。就在这危急关头，十斗士的斗士精神把新力量给予了另一个世界——现实世界的孩子…… 主角拓也等人，将进入数码世界，变身成数码暴龙，投入这场冒险与战斗的旅程！
“放弃梦想的方法，我不知道——” 终于与“憧憬的高中生”凤树实现共演的星谷悠太， 以下一个梦想为目标，每天在绫薙学园音乐剧学科努力修行音乐剧。 但他马上就要面临“新的试炼”……！ 第2学期开始，“绫薙祭”的班级公演近在眼前。 这是初次不借助指导者的力量，仅靠自己来挑战的舞台。 星谷等人越过队伍的壁垒，和新的伙伴共同携手， 为了创造出最棒的舞台而充满干劲，然而……。 阻挡在这样的2年级生面前的，是终于现身的“华樱会”！ 他们所提出的绫薙祭改革的一环，就是华樱会策划的全新环节“开幕式”。 被选为演出者的学生将会是次期华樱会的最有力候补， 但作为代价，将无法参加班级公演！？ 青春喧闹音乐剧物语，最后的帷幕拉起的瞬间。
缅因猫兽的暴走，以及由此引发的重启。 留下苦恼的芽心，太一等人前往数码世界。 重逢的搭档数码宝贝们，失去了至今为止的全部记忆。 即使如此也为了再次筑起羁绊，而伸出手去的被选召的孩子们，与回应此的数码宝贝们。 但，唯有比丘兽即使进化为成长期，也依然表现出警戒…… “所以说过去的事情我不知道啦！” 面对比起自己更加优先关心他人的空的好意，比丘兽反而抱持着不信任感。 对于因受伤而久久伫立的空，太一和大和找不到能对她说的话语。 接下来，应该在数码世界做些什么才好—— 在商谈此事的众人面前，缅因猫兽突然现身，之后又消失了。他不知为何残留着原先的记忆，寻找着芽心，含泪彷徨着—— 看到这副景象，孩子们为了拯救缅因猫兽而对数码世界之旅下定了决心。但，他们的面前却出现了那个驱使黑暗四天王的男人的身影。 此时，现实世界的西岛收到了姬川失踪的报告。 调查此事的他，查出了姬川至今为止的行动背后隐藏着某个目的。 此事还关联着决定了两人命运的过去的某件事……
