勇太（菅沼久义 配音）是一个普通的少年，一次偶然中，经人推荐，勇太进入了传说中的圣阿方索学院进行学习。这是一所地处月桂树环绕之中的全封闭式贵族学校，拥有完全独立的通讯系统。虽然被称作学校，但学院更多的被选择成为了名流们销声匿迹的藏匿之所。 勇太是全校唯一一个拥有手机的学 生，因此受到了众多学生的欢迎。在这里，他结识了正直可靠的王子乔舒亚（置鮎龙太郎 配音），前知名演员亚鲁法雷德（森田成一 配音），表面上高贵冷静，背地里却是个十足宅男的西鲁班古拉古（三宅纯一 配音）和炼金术师之家出生的腹黑男古鲁曼（野岛健児 配音）等。在相处的过程中，勇太发现，这些看似高不可攀的同学们，其实有着意外可爱的一面，从而与他们结下了深厚的友谊。
随着恶魔觉醒，人类世界陷入混乱。性格温柔的男孩与恶魔合体，在神秘好友飞鸟了的指引下，卷入一场残酷、堕落的对抗邪恶之战。
坐拥强大科学力量的帝国，以及以“魔女之国”的威名受到世人畏惧的涅比利斯皇厅。 在没有尽头的两国战场上，少年与少女相遇了。 以史上最低龄晋升帝国最强战力的剑士──伊思卡。 被称为皇厅最强的寒冰魔女公主──爱丽丝莉洁。 “若逮得住本小姐，你说不定真能实现自己的梦想呢。” “你才应该将我打倒，好让你能在统一世界的路上前进啊。” 两人以宿敌的身份展开了廝杀。然而，少年被少女的美貌和高洁的姿态夺走了心， 少女也迷上了少年的强大和生存之道。即便两人无法并肩而行，唯能战至一方倒下 相互敌对的少年少女，将展开革新世界的英雄传奇！
人気カードゲーム「デュエル・マスターズ」を題材とした松本しげのぶの漫画『デュエル・マスターズ ビクトリー』を原作とするテレビアニメ第２弾。監督の鈴木輪流郎をはじめとする前作の主要スタッフが、本作でもそのまま続投。五年生になった熱血小学生の切札勝太が、個性的なクラスメイトたちを相手に熱いカードバトルを繰り広げる。 エイリアンとの壮絶な戦いを終え、“日本一ビクトリーな奴”に輝いた切札勝太は、小学五年生として新学期を迎える。ぶっちゃけ、ヨーデル、べんちゃんたちと同じクラスになった勝太だが、個性豊かなメンバーが揃う新しいクラスはすでにハチャメチャな状態。更には２人の個性的な転校生が加わり、勝太たちは様々な騒動に巻き込まれると共に再び熱いデュエマを繰り広げていく。
