拉莉（Rally Vincent）与小美（May）是一对动作型与技术型的搭配（神枪手 爆弹专家），两人性格迥异，但齐心协力的时候杀伤力极大。

赏金猎人拉莉·云逊，19岁，以追缉逃犯维护生。闻着硝烟味才能睡着，睡着后无论怎么吵/被画猫脸/被摇晃，都不会醒，但是只要有人动她的枪就会立即反应并开枪。开着一家枪店，但生意惨淡。堪称新车杀手，每次换了新车都会在任务中报废……她一步步把罪犯逼得走投无路，也把自己推向险恶的边缘……

自称爆弹专家、拉莉称之为爆弹狂魔的小美，17岁，因曾在“紫猫馆”工作，使得外表停留在13岁左右的可爱小孩模样。身上总带着许多旁人看起来很奇怪的炸弹零件，丰富的炸弹知识是其男友（35岁）健·达基所教，因为身型矮小，因此对火药味非常敏感。

回应那一万二千年前的情感之时，思念的心将联系在一起。

当太阳、月亮以及火星再次相遇之时，全新的合体旋律再次响起――！

湘南的海上飘浮的小岛，江之岛。座落于此处美丽寂静的海边，正是“私立江之岛学园”。

一所集合全国各地优秀学子，并以最新机器实施英才教育的学园。

其中被选入为特别强化班学生“元素人”的飒虎、璃美也、外史三人，被迫按照命令驾驶着一种以情感之力发动的战斗机（VECTOR MACHINE），与谜之侵略兵器“神话兽”进行战斗。

在战斗的途中，飒虎在不可思议的幻象引导下，呐喊――。

“想星合体！GO，Aquarion！”在反复轮回的最后，机械天翅Aquarion就此现身。

背负宿命的少年少女们，在神秘团体“宇宙卵之会”及大人们的想法的交错复杂之中，逐渐发现这个宇宙的真相……。

这是，一个以自身的情感与宇宙的存亡为赌注所编织出的，壮大般地爱之神话。