高中生，四月一日君寻在偶然的机缘下闯入闻名异世界的次元魔女，侑子的魔法商店。四月一日在此许下要剔除自身灵能力的愿望 ，因此变成魔法商店的长期工读生，而围绕在他身边的同学小葵、百目鬼也同样是特殊能力者。在这之后，分散在其它异世界国家的小樱，小狼，黑钢与法伊皆因飞王的阴谋皆来到魔法商店。因而使得黑色摩可拿觉醒留在愿望商店陪在侑子身边。这是一个关于穿梭异世界和不可思议现象的魔法故事。

本片是从侑子收到来路不明的信开始讲起，那是一封召开拍卖会的邀请函。 在古老的邸宅里被招待的是7个狂热的收藏家。 据说他们都是为了完善自己的收藏而应邸宅主人的邀请来到这里的。 可是，等了很久都不见主人现身。 不久，收藏家一个接一个的离奇消失了… 充满神秘的馆主，不可思议的少女。一夜里接连发生了很多奇异的事情。 要拍卖的到底是什么呢？究竟招待的主人是谁呢？ 执着于将物品据为己有的狡猾而愚蠢的姿态以及住在馆里的主人超越时间的思念。 云雾缭绕的谜团的结果，以及悲惨的恋爱故事的结尾…

高中生四月一日君寻，有着异于常人的体质，他可以看到并且吸引各种鬼怪。他的好友百目鬼也是特殊能力者，有驱除妖魔的能力。在命运的牵引下，四月一日在壹原侑子的店里打工。这是一家可以帮人实现任何愿望的店，但是委托人必须付出对等代价。不久后，四月一日结识了一个少女灵能力者，五月七日小羽。 一天夜里，百目鬼的爷爷遥先生进入四月一日的梦中，委托四月一日帮自己找五件东西。因此四月一日便来到了百目鬼家中，和百目鬼一同到仓库处寻找“书虫”。他们在寻找的过程，遇到各种怪事，这一切究竟是现实，还是梦境…… 曾经的四月一日总是独自一人，然而他发现，经历了这一切之后，不仅自己发生了变化，身边的人也发生了改变。

故事开始于四月一日君寻和壹原侑子的命运相遇。自从遇到侑子后，四月一日遇到了形形色色的人和物，发生了许许多多的好事坏事，他自己也发生了很大的改变。然而店主人侑子留下了最后的愿望之后，却消失了。于是四月一日守在店里，等待有一天与她重逢。 这十年来，四月一日每日守着店，昔日的高中生业已成熟。这天，已经成为大学助教的百目鬼静来到店里，跟四月一日说起一件怪事。因为他是民俗学方面的专家，于是被一户大家族委托鉴定父辈遗留下来的古物。他发现了荼吉尼天手札，同时也发现这户人家十分不同寻常。四月一日通过录像接受了委托，于是派出管狐，让它和百目鬼一起到那户人家里完成任务……

这是一家可以实现任何愿望的店，只要委托人愿意付出对等的代价。在命运的安排下，有缘人必然会走进这家店里进行委托。高中生四月一日君寻，有着异于常人的体质，他可以看到并且吸引各种鬼怪。他身边的好友百目鬼和小葵都是特殊能力者。 原店主壹原侑子消失后，四月一日君寻便接管了这家店，成为新店主，日复一日地等着侑子回来。 某夜，百目鬼的爷爷出现在店里，委托四月一日帮他实现愿望。四月一日接受委托后，进入了百目鬼的梦境中。在梦境中，四月一日看到百目鬼和自己的种种过往，正面临着黑暗的吞噬。梦境与现实，前世与未来，他看到了自己和身边人之间息息相关的命运。最后，回到现实的四月一日，发现百目鬼静居然来到店里拜访……

故事讲述能看见妖怪的“四月一日君寻”进入了别名为次元的魔女并自称伪名为“壹原侑子”所拥有的能够实现任何愿望的店。而当时四月一日正为自己能够看见妖怪而烦恼，而侑子说只要四月一日能付出对等的代价，就可以帮助四月一日实现“可以让你看不见妖怪，而且，让妖怪不受你的血所吸引”的愿望。因此，四月一日答应侑子的条件，而侑子就开出让四月一日在其店中打工作为代价，而实现其愿望。而故事就是围绕四月一日在侑子的店中所遇到的怪异事件。